伴随着生命科学与生物技术的飞速发展，生物产业正展现出不可限量的前景，美国《时代》周刊预言：“世界将进入生物经济时代，……生物经济将10倍于信息经济。”我国已明确把“培育生物产业”，作为国家战略性产业予以重点发展，云南加快生物产业发展既面临着难得的机遇，又面临着严峻的挑战，如何抢抓机遇，尽快做大做强生物产业，是云南加快发展中的一个重大课题。
生物产业发展中存在的突出问题
科技创新不足。科技创新不足，是加快生物产业发展的最薄弱环节。在思想观念方面，对国际经济全球化、国内经济市场化、信息传播网络化认识不足，不少地方生物产业的开发仍停留在传统的生产模式上，种植、加工粗放，原料综合利用率低，市场化、信息化和产业化程度低。在管理体制机制方面，行业指导、管理体制有待健全，多头管理问题突出，往往造成有限的资金和资源被分割，严重影响了生物产业的快速发展。在技术创新方面，除烟草等少数产业外，产业自主创新能力弱，缺少核心技术，科技成果转化率低，生物产业企业远未成为自主创新的主体，也远未成为自主创新人才的主体，高素质人才特别是高级技工进一步短缺。在品牌创新方面，具有自主知识产权的新专利、新技术、新品种严重缺乏，云南花卉种源主要依赖国外进口，缺乏知识产权使云花企业缺乏核心竞争力，荷兰花卉2003年每公顷平均产值约10万美元，而云南2003年平均产值仅为11.92万元人民币，相差近7倍。
产业聚集度不高。重点企业布局分散，低水平重复问题突出，形不成集群效应和规模效应，集中表现为散、小、弱、杂。“散”主要是产业集聚程度不高、点多面广、配套能力差、辐射带动能力不强，如云南是全国四大林区之一，但林业第一、二、三产业结构比重为72.0∶20.5∶7.5，在“十五”限额采伐消耗量中，农村烧柴占59.2%，农民自用材占27.2%，商品材仅为13.6%，“大资源、小产业”的状况没有得到根本性改变。“小”主要是产业规模和企业规模偏小，比如医药产业单品种销售收入上亿元的不足10个，云南茶叶初制企业3000余家，有独立法人资格的近500家，其中中小企业占98%，普遍太散、太小、太乱；“弱”主要是企业技术创新能力和新产品研发能力不够强，云烟与发达国家相比，差距仍然较大，世界最大的烟草企业菲莫公司，年产量近2000万箱，一个品牌900多万箱。2004年全国产量上百万箱的卷烟品牌有“白沙”、“红河”、“红梅”3个，云烟占了两个。2005年，百万箱品牌增加了“红金龙”、“哈德门”、“黄果树”3个，云烟一个也没有增加，除云烟外，生物产业总体上技术装备还比较落后，产品缺乏核心竞争力；“杂”主要是产品杂乱，一个产品就有几家甚至十几家厂商生产，一个企业生产七八种，甚至几十种产品，没有自己的拳头产品。茶叶品牌多、乱、杂问题突出，云南作为全国的产茶大省，尚未形成具有高知名度、高市场占有率的知名品牌，精深加工产品不足3%，基本上是初级产品，茶饮料、茶食品、茶保健品等新产品开发，以及提取茶多酚、儿茶素等深加工，尚处于孕育起步阶段。
融资难问题突出。投融资体制不健全，多元化投入渠道不畅，融资难已成为制约产业发展最突出的问题。由于生物技术企业大多数为中小企业，且为高技术行业，无形资产远大于固定资产，没有过多的固定资产作抵押或担保，很难得到银行贷款；由于金融创新不足，风险投资不发达，真正投资于生物企业特别是投资处于种子期或早期阶段的生物技术企业的风险投资机构很少，生物企业得到风险投资的支持较少；由于金融体制改革滞后，特别是非国有中小型银行等金融机构严重滞后，难以形成创业板市场，中小型生物企业不能直接从资本市场上募集资金；由于公平、公正的市场竞争环境还没有完全形成，个体私营企业和外商参与生物产业开发创新的积极性还没有充分调动起来，多元化投资渠道尚未形成；由于政府的引导性投入不够，缺乏优惠政策的专项扶持，很多企业因缺乏足够的资本金或担保，很难申请到贷款。
市场开拓力度不够。在国内外市场具有一定竞争力的产品和企业还不多，还缺乏战略性研究和谋划。虽然培育了一批名优产品，但是总体上名牌产品少，市场占有率不高，2005年全国生产卷烟3900万箱，云南卷烟产销量631万箱，不足1/6，全国卷烟实现利税2600亿元，云南399亿元，也不足1/6。2005年，全国一类烟产量超过20万箱的“中华”、“芙蓉”、“利群”、“白沙”4个品牌中，云南产品未有一席之地。除烟草之外，其它生物产业，由于企业规模偏小，缺乏研发机构、人才和费用，导致产品档次低、附加值不高、市场竞争力不强。食品加工业和饮料制造业占工业比重仅相当于全国平均水平的48%和34%，食品制造业水平更低，其在云南工业中所占比重仅相当于全国平均水平的15%，竞争力落后于全国平均水平。从医药产业的发展来看，尚缺乏世界级大型跨国医药企业，在国内拥有很高知名度和市场占有率的大型企业也较少，相当部分医药企业缺少市场开拓和营销能力，影响医药产业规模的扩张和国内外市场对“云药”品牌的认知。从茶产业来看，世界上已发现的37个种3个变种中，云南就有33个种2个变种，且25个种1个变种为云南独有，在全国19个产茶省区中，全省有99个县生产茶叶，茶园面积达287.9万亩，居全国第一位，参与种茶、制茶、销茶的人达到1300万人，但是多年来，云南茶叶产量却位于福建、浙江之后，茶叶出口仅居全国第19位，创汇排在全国第8位。由于茶叶质量体系建设和标准制定严重滞后，伴随着不规范的市场炒作和不健全的管理，普洱茶热销的同时，假、冒、伪、劣产品混杂，市场亟待规范。
缺乏健全的法规政策体系。按照与国际经济接轨的标准衡量，云南发展生物产业的许多政策法规仍然不够健全，有的方面甚至明显滞后。从税收政策来看，许多国家都制定了扶持其发展的税收优惠政策。例如，加拿大魁北克省为促进生物产业发展制定了研究开发零税收政策，从而吸引了大批跨国公司到该地区建立研发中心。但在云南，由于生物企业大多是中小企业，不仅难以享受到优惠，由于增值税附加值较高，物料投入价值低，导致进项税额扣除少，现代增值税税制下生物技术企业的实际税负明显偏高。而且由于生物技术产品开发不仅耗资巨大，技术
